城乡分割的二元结构制度是城中村产生的根源，也是城中村改造中的难点所在，之所以称之为难点问题，关键在于其涉及城中村改造的对象——农民的切身利益。可以说，农民是二元结构制度的既得利益者，力求维护二元结构制度所产生的生存状态，使其产生了路径依赖，这种路径依赖使得城中村的状况陷入长期的非效率的锁定状态。

路径依赖类似于物理学中的惯性，一旦进入某个路径（无论是好还是坏）都可能对这种路径产生依赖，路径依赖形成的原因中最主要的就是利益集团的因素，利益集团是存在自身利益需要的集团。这些利益集团对现存的路径有着强烈的需求，他们力求巩固现存的制度，阻碍选择新的路径，哪怕新的体制比现存的体制更有效率。在城中村改造过程中农民是既得的利益集团，他们从二元结构制度中受益匪浅，正是由于利益的内在驱动，使得村民不愿改变旧有的制度安排，相应地二元结构制度就产生了路径依赖的效应。

农民从二元结构制度中得到很多利益，如农村土地产权制度所带来的租金收益、农村人口管理制度所产生的三大优势和农村村委会管理制度带来的集体经济的分红和福利等，这使得作为理性经济人的农民强烈地依赖于这种制度安排，并力求维护之。

首先，二元土地产权制度的租金收益。我国实行的是二元土地产权制度，农村土地所有权归集体所有，国家难以征用农民的宅基地，农民对宅基地具有相对自由的使用权。城中村的“孤岛”形成后，村中的农民却因外来人口急剧涌入城市而带来了难得的获利机会。特别是随着城市的经济发展，城市的土地价格也日益攀升，高昂的地价使处于优越地理位置的城中村聚集了雄厚的集体财富，无耕地的村民凭借其有利的区位条件在自己拥有使用权的宅基地上大量地建造房屋以供出租，并以此获得了不菲的收入，城中村村民成为新型的租金食利阶层。村集体开始在留用地上与房地产商合作开发商业地产和住宅，农民则在各自的宅基地上疯狂地建房。建房者在有限的宅基地上，一方面通过超高建筑来实现利益最大化，另一方面通过侵占公共空间来实现利益最大化。从个体理性选择的角度看，城中村这种特殊的建筑群体和村落体制的形成，是农民在土地和房屋租金快速增值的情况下，追求土地和房屋租金收益最大化的结果。这种收入模式使得局面开始发生逆转，由原来城市排斥城中村转变为如今的城中村拒绝被城市化、市民化，经济收入的路径依赖极大地强化了城中村长期存在和发展的现实性与被拆迁改造的艰难性。

其次，人口管理制度给农民带来的三大优势。我国一直实行的是城乡二元的户籍制度管理，虽然城市居民在很多方面优越于农村居民，但城中村村民在某些方面也有比城市市民优越的地方，如可以同城市居民一样享受到城市的设施、交通、入学等，而同时他们又可以像其他农村村民一样享受到“计划生育、人口迁移、宅基地分配”三大优势。在计划生育政策方面，城市户口只能生一胎，而农村户口却可以合法地生两胎，在人口迁移政策方面，因为城中村是农村建制，从农村迁移入户城中村则比较容易，属于乡—乡迁移流动，一般不受国家计划控制，在宅基地分配与使用方面，按政策城中村内的每户村民都可以分到一块宅基地，宅基地当初的取得成本几乎是无偿的。但现今城市土地的升值，使得许多中村村民的生活问题就靠它来解决。这就使许多城中村的村民不愿转变户籍，成为市民的一员。

因此，计划经济时期形成、旨在抑制人口流动的户籍制度，在当今人口自由流动的时代仍然发挥着它极大的“束缚”和“锁定”功能。城中村在城市化的过程中，人口本应随着土地同时实现非农化，然而由于户籍制度的“锁定”，使得土地城市化了，村民却仍然是农民。户籍制度迟迟未“松绑”，使得城中村的村民由边缘人群迅速转变为既得利益者，他们在享受城市提供的交通、教育等各种公共服务、设施的同时，仍然可以享受其他农民应有的权利，这种双福利加强了他们对目前现状的认同。

最后，农村的行政管理制度的集体经济分红与福利。目前，城中村的管理体制基本上是属于农村管理性质，这种管理体制的特点：一是党、政、企高度合一，党支部、村委会、村集体经济三种组织结构的结合，其中党支部和村委会作为村集体企业的决策层，而分散的村民则成为分红的股东。二是职能上的全能化。村委会成了管理全村政治、经济、思想、生活等社会职能的小政府，对村民实行一种统包统揽的全方位全能化管理。

不少城中村的村集体收入主要来自物业收入，由于城中村地价的升值，使得一些城中村的集体财产数额也相当惊人，村民作为村集体经济股份合作制的股东，能够按照股份分红，且分红的金额相当可观。在城中村行政管理制度中，村民委员会还要负责村集体的福利，如老年村民的养老金、村民的医疗补贴、村小学教师工资外的福利补贴及小学硬件建设、村道路和管线的建设、村民服役的补贴、献血补贴、上高等学校补贴，等等。村集体的分红和福利制度使得村民产生一个村籍的身份，拥有村籍就意味着拥有一系列的收益与福利，这就加深了村民对这种村落管理制度的依赖。

二元经济结构产生城中村，利益驱使使二元经济结构长期存在。城中村改造的一个核心问题就是土地问题，所以城中村的转制和改造，以及进一步的城市化都离不开对土地产权和土地资产经营的研究和探析。