“柯南。”星期六的早上，毛利兰叫住了正在看电视的柯南。
“小兰姐姐什么事？”柯南问道。
“自从你爸爸妈妈把你寄宿在我们家，到国外出差已经过了很久了，难道你一点都不会寂寞吗？”小兰站在柯南的旁边问道。
“不会。”柯南摇了摇头，继续看电视。
“真是的，这是什么爸爸妈妈啊，从来都没露过面不说，连个联络都没有。”毛利小五郎道。
“唉！看来谎言快要被揭穿了……”柯南心想：“其实我的爸爸妈妈还真在国外，也不算是全在说谎。”
毛利小五郎走到了小兰的旁边，道：“我记得当他的父母是把他拜托给阿笠博士的吧，既然这样的话，我们去向博士问问，他爸爸妈妈的电话会比较好。”
“不行。不能联系博士。”听到这里的柯南立即跳了起来。
而这个时候门铃响了，小兰应了一声就跑过去开门了，从外面进来了一个胖女人。
“柯南，你妈妈来了！”小兰兴奋的道。
胖女人道：“对不起，柯南，你一个人一定很寂寞吧，你可以放心了，跟妈妈一起回家吧。”
柯南心中纳闷的很：“这女人谁啊？”
为了证明自己的身份，那个胖女人亮出了自己的身份证，将柯南带走了。
柯南不愿意，还是被胖女人带走了。
毛利小五郎一直对着远去的车大喊，道：“江户川夫人，请不要忘记谢礼哦。”
在车上的柯南盯着那个女人问道，道：“大婶，你到底是谁？”
“呵呵，我刚才不是说过了吗？我是你的母亲啊。”胖女人道。
“你说谎，我的母亲是……”柯南说到一半停顿下来。
“工藤有希子。”那个肥女人一脸阴沉的说道，道：“你的母亲就是那个会迷惑全世界的男人，以十九岁芳龄得到大奖以后，就来到日本的美艳女星。但是她跟年轻的小说家工藤优作相爱，二十岁就结婚了，于是他急流勇退，后来就生了一个儿子，可是现在却把儿子丢在了这里，跟他那个世界级的推理小说家丈夫一起到国外玩了，对不对？你就是他的独子，工藤新一！”
柯南瞳孔一缩，心道：“难道这个人。就是逼我吃药然我身体变现的那个黑衣男人的同伴吗？”
正想要做什么动作的柯南却被一把枪指住了，道：“你可别乱动，你要是乖乖的，我就带你到一个好地方去，那里可是有趣多了。”
结果柯南趁着那女人不注意，一把扒开了她手中的枪，踩到了汽车的油门上，车子失去平衡撞到了栏杆上，柯南打开车门逃了出去。
回忆起之前的一次卡拉OK事件，柯南边跑着边心想：“自己使用了工藤新一的声音，让我暴露了，可是我明明告诉了目暮警官让他替我保密的。也许警察局里就有黑衣组织的间隙。我真是大意了。现在该怎么办……”
车上的那个胖女人给另一个人打了电话，听口气就是顶头上司，道：“对不起，让他跑掉了，不过我猜那个小孩一定就是工藤新一，错不了的。”
电话里的男人一阵冷笑，道：“是吗？原来这个家伙真的变小了，立刻给我去找，让他到警方那里的话就麻烦了。”
“可是。到哪里去找呢？”
“不用担心，他下一个一定会去的地方就是阿笠博士的家里。”
柯南的确去找阿笠博士了。他来到阿笠博士家，却不见阿笠博士的人影，心中急道：“阿笠博士会去哪里啊？”
突然柯南看到阿笠博士从远处走来了，刚想上去打招呼却发现自己被一块手帕蒙住了鼻子和嘴，随后失去了意识。
不久之后，柯南醒了过来，他看看周围。“这里是哪？好像是厨房。”想到这里柯南站了起来，道：“可恶，我的头到现在还是晕晕的。”
跳到了橱柜上之后，柯南顺着窗户往外看，道：“原来。他们趁着我失去意识的时候，把我带到了这栋房子的二楼了。”
这时，柯南听到门外面有谈话的声音，于是从橱柜上跳了下来悄悄的走到门口，偷听了起来。“什么？你还没把他给杀了？”一个男人说道。
“请不要为难我好不好，这可是上级的命令，”那个胖女人解释道。“上级说他的药物副作用是个特例，所以必须把他带回到组织里面。”
“那个男人是谁？”柯南透过门的缝隙，看到那个男人突然间转过了头，而且脸上带着一个面具，而且那个家伙正向这里走来，于是柯南急忙回到原地假装昏迷。
“那个小鬼还没有起来吗？”胖女人问道。
面具男摇了摇头，道：“还没有，我看药效大概还在，不过，里面的那个真的是高中生工藤新一吗？我到现在也还不太相信，不过工藤新一失去下落的那一天，跟这个小子出现在事务所的日子刚好一致，而且在这之后发生在毛利小五郎身边的事情每一件基本都圆满的解决了。”
“还有我抓他的时候他的反应。所以我想这一定是组织新开发的那种药让他的身体整个的变小了。”面具男冷笑了几声，道：“这么说，我也来试试看，组织开发的那种药，我在出来的时候也带了一点在身上，我只要让别的人服下这种药，就知道它是不是能够让人变小了。”
那个胖女人一头冷汗的说道，道：“但是你要让谁吃这种药？”
“就是明天要跟我们交易的那个男人，组织不是早就说过交易结束就要我们把他解决了吗？我正好那这个来试试他。”
“知道这个药能表现了之后你有什么打算？”
“总之先把交易的那个男的给杀了，然后再把这个小鬼给解决掉。”
“我不是跟你说过了吗？组织要调查这个小鬼身上的副作用，上级已经命令我要带他回去了，你不懂吗？”胖女人在听到面具男要杀掉柯南的时候显得很激动的说道。
“哼！知道组织的秘密的人，还能够让他活着吗？”
“可是！”
“不要说了，我已经这么决定做了。你要是再啰嗦，我不介意多出一条尸体。”
看着用枪指着自己的面具男，肥女人点了点头：“我。我知道了。”
面具男收回了枪，道：“你已经告诉那个男的明天交易的地点了吗？”
“还是照我们用的老方法，交易的时间在十三点。”
“恩！”面具男点了点头，道：“我们现在可以好好的睡一觉。”
夜里，柯南偷偷的从门的缝隙看着那两个人，道：“他们两个都睡着了，先得把绳子解开。”柯南弄了一夜，才解开自己身上的绳子，但是一想到那两个人即将醒来，自己跑不了多远，于是想了一个计谋。
早上，当那两个人来到了关押柯南的房间的时候，发现柯南已经不再了，道：“可恶。那个小鬼不见了。”
那个胖女人说到，道：“我醒来的时候他就不见了，一定是从窗子逃走了。”
面具男走到了窗户口往下看，一条绳子直通地面，但是地面上没有脚印。
“他根本就没有走。”面具男忽然冷笑。
“这是什么意思？”胖女人疑惑地问。
“这只是一个小计谋而已，让我们以为他逃走了，然后离开这里去追他。其实他还在这个房间的某个角落。”面具男说话的时候已经盯住了角落的衣柜。
“什么？怎么会……”躲在衣柜里面的柯南不敢相信自己听到了这些。
这时，他看到了胖女人和面具男正缓缓走过来。
“不行！我要想办法……”柯南慌张之余看到了自己的手表，心道：“对了，等他们过来的时候用手表麻醉枪对付那个面具男，再趁着胖女人惊讶时一脚踢开她。”
“侦探游戏结束了。”面具男从衣服里面掏出枪，来到衣柜前，小心翼翼地打开衣柜。
柯南这时也准备使用手表麻醉枪，但是忽然他感觉衣柜正在往下倒。接着他的身体不由地在衣柜里翻滚了一阵，便晕了过去。
醒来的时候，柯南正坐在椅子上，而且被绳子帮助。他头脑有些晕眩，摇摇头，睁开眼睛看到面具男和胖女人正得意地盯着自己。
那个面具男已经拿着枪对着自己的脑门。
“这个人好厉害……之前到底是怎么回事？”柯南心中急想道。
“还是你厉害，以防他用手表麻醉枪反击，直接把衣柜翻到，让他在衣柜里晕倒。”胖女人对面具男笑道。
“哼。这种小把戏怎么可能骗得了我？”面具男冷淡地道，拿着黑色的手枪对准了柯南的额头。
“糟糕……怎么办？难道我就要……”柯南的双眼有些绝望，心中慌乱不已。
“名侦探柯南，永别了。”面具男冷冷地道，右手食指扣动扳机。
“嘭！”一声枪响在柯南的额头前响起。
“我死了？”柯南紧闭着眼，但是感觉自己的心还在跳。
“新一。”这时柯南听到一个熟悉又温柔的声音。他小心翼翼地睁开眼睛，只见胖女人笑着扯下自己的装扮，变成一个身材丰满的美丽女人。
“妈妈……”柯南有些不敢相信自己的眼睛。
“呵呵。”面具男温和地笑了笑，摘下面具。
“爸爸……”柯南更加惊讶。这两个人正是柯南的爸爸和妈妈，也就是工藤优作和工藤有希子。
“怎么样？我和你爸爸合演了一出坏人捉拿名侦探的戏，是不是非常厉害？”工藤有希子得意地对柯南道。
“无聊。”柯南很快地想通了整个事件，淡淡地道：“快解开绳子。”
“别急嘛。”工藤有希子为柯南解开绳子。
“是不是阿笠博士告诉你们我变小的事？”柯南问。
“不错。”工藤优作道：“你放心，我们会找到解药让你变回原样的。”
“不用操心。我自己的事情自己解决。”柯南坚定地道。
“新一，你别逞强啊。”工藤有希子温柔地道。
“我已经长大了，而且我……还是个名侦探。”柯南坚持自己的要求。
工藤优作考虑再三，同意柯南的主张，留下了一笔抚养费由阿笠博士转交给毛利小五郎之后，便和工藤有希子又去美国旅游了。而柯南则是受到毛利小五郎的热情欢迎，继续居住在毛利侦探事务所。